El aeropuerto de Skopje utiliza una terminal común para todos los vuelos. El edificio es muy pequeño pero está bien diseñado. Tras el control de seguridad, cabe esperar escasez de asientos en los momentos en que salen varios aviones a la vez.
La orientación es fácil y las distancias dentro de la terminal muy cortas.
El control de pasaportes a la llegada es eficaz y el tiempo de espera suele ser de entre 10 y 20 minutos.
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Traslado entre vuelos
Skopje no es un aeropuerto típico para hacer transbordos. La mayoría de los traslados no están garantizados, es decir, los viajeros crean su propio traslado a partir de dos billetes independientes.
Aunque no lleve equipaje facturado, siempre debe pasar por el control de pasaportes a su llegada, salir y volver a pasar por el control de pasaportes y de seguridad para regresar a la zona de tránsito.
Normalmente, todo el procedimiento dura entre 20 y 40 minutos.