El principal aeropuerto de Lituania, situado a 7 km al sur del centro de Vilna, opera principalmente vuelos a Europa occidental y meridional y a Escandinavia. No hay vuelos directos de larga distancia a Vilna.

Dado que Lituania no cuenta con una aerolínea nacional propia, la mayoría de los vuelos son operados por Wizz Air y Ryanair.

La aerolínea letona Air Baltic también tiene uno de sus centros de operaciones en Vilna, desde donde vuela a países vecinos, ofrece vuelos de temporada al sur de Europa y opera rutas a los principales aeropuertos europeos.

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Al viajar a Lituania, muchos viajeros combinan el aeropuerto de Vilna con el de Kaunas ( KUN), situado a 100 km, al que llegan numerosos vuelos de Ryanair.